ProteinMaker

[카테고리:] 단백질 발현

  • [기술 혁신] 초거대 리보솜 복합체(4V9C)의 구조적 한계를 극복하다: HanjariFold-Endgame 리파인먼트 성공

    안녕하세요, ProteinMaker입니다. 오늘은 당사의 독자적인 분자 정밀화 엔진인 HanjariFold-Endgame을 활용하여, 구조 생물학계의 거대 타겟인 70S 리보솜(Ribosome) 복합체(PDB ID: 4V9C)를 세계 최고 수준의 정밀도로 최적화한 사례를 소개해 드립니다. 1. 배경: 리보솜, 30만 원자 데이터의 무게 2012년 Nature Structural & Molecular Biology에 발표된 리보솜 구조(4V9C)는 생명 현상의 핵심을 담고 있는 위대한 성과물입니다. 하지만 3.30 Å 해상도에서 규명된…

  • Official Launch of the HanjariFold Research Access Portal for High-Precision Structural Refinement

     We are pleased to announce the opening of our researcher-dedicated test server for HanjariFold, now accessible at hanjarifold.net. Following extensive internal benchmarking and rigorous validation, we have confirmed that our latest refinement engine delivers exceptional performance. By integrating our core philosophy of Cosmic Biomechanics with deterministic physical learning models, the engine consistently achieves high-percentile structural…

  • [데이터 리포트] CRISPR-Cas9의 정밀화: AF3를 넘어 100th Percentile 무결성 달성

    단백질 구조 예측 AI인 AlphaFold3(AF3)는 혁신적인 도구이지만, 거대 핵산 복합체(Nucleoprotein) 시뮬레이션에서는 여전히 미세한 기하학적 오류를 남깁니다. 본 리포트에서는 유전자 가위로 잘 알려진 4UN3(Cas9-sgRNA-DNA 복합체)를 대상으로 HanjariFold ZENITH 엔진이 달성한 물리적 정제 성과를 팩트 중심으로 요약합니다. 1. 주요 지표 비교: AF3 원본 vs HanjariFold ZENITH 가장 객관적인 구조 검증 지표인 MolProbity 분석 결과, HanjariFold는 거대 복합체의…

  • “정제 후 농도가 0이라니…” 소중한 단백질과 시간을 지켜줄 EPRM Analyzer v2.4 공개

    단백질 정제 실험을 마친 뒤, NanoDrop 앞에서 한참을 망설였던 기억이 있으신가요? 분명 서열은 문제가 없었고, 키트도 비싼 것을 썼는데 결과는 ‘농도 부족’. 며칠간의 노력이 물거품이 되는 그 허탈함은 연구자라면 누구나 한 번쯤 겪는 고통입니다. 이제 ‘운’이나 ‘직관’에 의존하는 정제는 그만두셔도 좋습니다. 단백질 서열의 물리화학적 성질을 꿰뚫어 보고, 실험실의 시스템 오차까지 계산해내는 EPRM(Effective Protein Recovery Mass)…

  • MST 데이터 분석, 아직도 엑셀로 씨름하시나요? 논문급 Kd 피팅 스크립트 무료 공개

    실험실에서 MST(MicroScale Thermophoresis) 장비를 써보신 분들은 공감하실 겁니다. 장비가 주는 원본 데이터는 훌륭하지만, 이를 논문에 쓸 수준으로 정리하는 과정은 결코 만만치 않습니다. “여러 번 반복 실험한 데이터를 어떻게 하나로 합쳐서 보여주지?” “이상치(Outlier) 하나 때문에 피팅이 꼬이는데, 이걸 객관적으로 제거할 방법은 없나?” “통계적으로 엄밀하게 ANOVA나 Bonferroni correction을 적용해야 하는데…” 이런 고민들을 해결하기 위해 제가 직접 개발하여…

  • 단백질 발현 및 정제 심화 보고서: 최신 동향 및 기술적 도전 과제 분석

    1. 서론 단백질은 생체 내에서 다양한 기능을 수행하는 핵심적인 고분자 물질이며, 생명 과학 연구, 진단, 그리고 의약품 개발에 있어 필수적인 요소이다. 특정 단백질의 기능, 구조, 상호작용을 이해하고 이를 응용하기 위해서는 고품질의 순수한 단백질을 대량으로 확보하는 것이 선행되어야 한다. 단백질 발현 및 정제는 이러한 목표를 달성하기 위한 핵심적인 생명공학 기술로, 지난 수십 년간 비약적인 발전을 이루어왔다.…