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  • [구조생물학/계산화학] Pim1 카이네이스 복합체(4JX7)의 핵심 도메인 타깃 초정밀 하이브리드 리파인먼트 완결 리포트

    단백질 카이네이스(Kinase) 도메인 연구에서 리간드-단백질 복합체 구조는 가상 스크리닝(Virtual Screening)과 분자역학 시뮬레이션의 핵심 인프라 데이터입니다. 실험 구조생물학 관점에서 결정(Crystal)을 안정적으로 성장시키기 위해 투입하는 기질 펩타이드 첨가제(Additive)나 N/C-말단 영역은 초기 구조 규명에 필수적인 요소입니다. 다만, 이후 이 구조를 유저들이 신약 개발 가상 도킹이나 분자역학 시뮬레이션 등 실전 가상 실험에 곧바로 활용할 때는 가장 중요한 약물 결합…

  • 구조 생물학의 임계점을 넘다: MolProbity 0.50 & Rama Z-score 0.55 달성 리포트

    단백질 구조 리파인먼트(Refinement)의 세계에서 “어디까지 정밀해질 수 있는가?”라는 질문에 답은 대개 통계적 한계선에 부딪히기 마련입니다. 하지만 최근 진행된 HanjariFold-Endgame 엔진의 테스트 결과는 그 한계선이 다시 쓰여야 함을 증명했습니다. 🧬 ZENITH V34: AI가 제안하고, 물리 법칙이 완성하다 이번 분석 대상은 약 242개의 잔기와 DNA 복합체(12 bp)로 구성된 시스템이었습니다. 흥미로운 점은 초기 모델로 사용된 AI(Boltz) 생성 구조가…